1998 yılında ankara üniversitesi hukuk fakültesinden mezun olan muzaffer şakar, 2001 yılında hâkimlik mesleğine başladı. kocaeli, ardahan, çankırı, kilis hâkimi olarak görev yaptı.yüksek lisans tezini ifade özgürlüğü konusunda yazan şakar, halen ankara üniversitesi hukuk fakültesinde doktora çalışmalarını sürdürmekte ve yargıtay tetkik hâkimi olarak görev yapmaktadır. demokrat yargı derneği başkan yardımcısıdır.
orhangazi ertekin, uğur yiğit, kemal şahin ve faruk özsu ile birlikte "türkiye'de yargı yoktur" kitabını yazmıştır.